Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms