Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms