Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CIPCQ9C0C6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CIPCQ9C0C6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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