Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms