Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRIP1Q9BX63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms