Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF4Q9BUZ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms