Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms