Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms