Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms