Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC17Q96LX7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms