Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A4AQ96JQ5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A4AQ96JQ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms