Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms