Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED3Q96IU2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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