Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAX2Q96IS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms