Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN37Q96GY3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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