Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCMH1Q96GD3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms