Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA10Q969M2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA10Q969M2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms