Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERVK_113Q902F9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113Q902F9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HERVK_113Q902F9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms