Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRSF12Q8WXF0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRSF12Q8WXF0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms