Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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