Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCAF4Q8WV16 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms