Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms