Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF248Q8NDW4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF248Q8NDW4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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