Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC191Q8NCU4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms