Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC197Q8NCU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms