Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP38Q8NB14 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP38Q8NB14 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP38Q8NB14 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP38Q8NB14 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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