Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC24Q8N4L8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms