Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms