Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNE4Q8N205 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE4Q8N205 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms