Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D4Q7Z3S7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms