Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCQ7RTU9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCQ7RTU9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms