Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAXIP1Q6ZW49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms