Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms