Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms