Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDK2Q58EX2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms