Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM259Q4ZIN3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms