Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYTL3Q4VX76 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms