Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ40

CCDC144B, Coiled-coil domain-containing protein 144B, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144BQ3MJ40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144BQ3MJ40 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144BQ3MJ40 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms