Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms