Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms