Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TYSND1Q2T9J0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms