Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms