Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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