Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HMGN3Q15651 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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