Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms