Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN2CQ14957 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN2CQ14957 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN2CQ14957 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN2CQ14957 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIN2CQ14957 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIN2CQ14957 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms