Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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