Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSPNQ14714 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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