Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms