Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE7AQ13946 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE7AQ13946 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE7AQ13946 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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